К 30-летию издания трехтомника
«МЕТАБОЛИЗМ: СТРУКТУРНО-ХИМИЧЕСКИЙ И
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ»
I. От правила “два-три-четыре» - к закону окисления углерода
Правило «два-три-четыре», о котором шла речь в предыдущей чести, по существу, очень настойчиво указывало на связь между
- тем, насколько уже окислен ОУФ,
- и тем, какой будет энергия его последующего однократного окисления.
Ведь, очевидно, что количество мол. АТФ, образуемых за счёт окисления в метаболите какого-либо ОУФ, так или иначе связано с энергией окисления этого ОУФ.
Откуда можно предположить, что в окислительной реакции энергия тем больше, чем более окислен окисляемый ОУФ.
Хорошо бы проверить эту гипотезу на конкретных цифрах. И заодно выяснить, насколько общей она является.
Наиболее легко было найти данные для метана и продуктов его последовательного окисления; приведённые ниже значения представляют энергию полного окислительного распада вещества до углекислоты и воды:
метан → метанол → формальдегид → муравьиная к-та → диоксид углерода (СО2).
–816 –702 –526 –270 0 (кДж/моль)
Построенный по ним график имеет вид гиперболы, убывающей от точки к точке всё сильней и сиьней.
Обнаружив это, я испытал сильнейший восторг! Ведь, если перейти непосредственно к энергиям каждого окислительного перехода, то получаем идеальное соответствие гипотезе:
метан → метанол → формальдегид → муравьиная к-та → диоксид углерода (СО2).
– 114 –186 –246 –270 (кДж/моль)
Может быть, читатель помнит: в разделе 3.3 я отмечал, что ввел в систему ЭХО (элементарных химических операций) подразделение операций по параметру nh – количеству связей углерода реагирующего ОУФ с гетероатомами.
Ввёл именно в связи с описываемой закономерностью.
В ряду метана этот параметр последовательно меняется от 0 до 4. И тогда на языке системы ЭХО полученная закономерность означает, что
- в рассмотренной непрерывной цепочке окислительных операций по мере увеличения nh реагирующего ОУФ энергия операции неуклонно возрастает (по модулю).
Но пока это – только в одной метановой цепочке. А что в остальных?
Окончательно ответить на этот вопрос я смог только по завершении создания системы ИнкОУФ (инкрементов ОУФ в энергию Гиббса сгорания веществ).
Других цепочек – довольно много. Правда, все они короче метановой: содержат по 2 или 3 операции последовательного окисления исходного углеводородного ОУФ (например, -СН2-).
Так вот, абсолютно во всех цепочках выполнялось то же правило, что и в цепи окислений метана.
Вначале я обозначил это как нелинейный эффект в окислении углерода,
потом – как первый нелинейный эффект (поскольку обнаружились и другие),
а к концу своего исследования, когда осознал всё значение этого феномена для метаболизма, возвёл его в ранг закона – ЗАКОНА ОКИСЛЕНИЯ УГЛЕРОДА.
II. Основополагающий закон метаболизма
Конспективно перечисляю осознанное.
1) Правило «два-три-четыре» можно считать первым следствием данного закона. Напомню, это правило определяет количество молекул АТФ, которое может получить клетка при окислении в метаболите того или иного ОУФ.
А что значит «получить»? Это значит, что в клетке должны присутствовать механизмы, способны учитывать энергетические возможности разных типов окисления.
2) Анаэробная жизнь: многие формы этой жизни обязаны своим существованием тому же закону. Да, у анаэробов не происходят чисто окислительные реакции и кислород не используется.
Но, как правило, источником энергии служат процессы, сочетающие окисление одного типа и восстановление другого типа. Более конкретно, в операции окисления должно высвобождаться энергии больше (по модулю), чем поглощается в операции восстановления.
А такая возможность возникает только благодаря энергетической неэквивалентности окислений разного типа, о чём и гласит закон окисления углерода.
Пример: широко известный гликолиз – распад глюкозы на две молекулы молочной кислоты (лактата). Этот в целом неокислительный процесс содержит
- два окисления ОУФ с nh =2, дающие примерно по –250 кДж/моль,
- и два таких восстановления, которые обратны окислениям с nh=0 и поэтому поглощают примерно по +150 кДж/моль.
Итог – высвобождение части энергии глюкозы:
(-250 +150)×2 = -200 кДж/моль.
Обобщая, можно сформулировать правило экзергоничности для сложных реакций вида (ЭХО О + ЭХО О–): эти операции экзергоничны, если в реакции показатель nh окисляющегося ОУФ выше аналогичного показателя того ОУФ, в который переходит восстанавливающийся ОУФ.
3) ЭХО С. Для операций разрыва связи С-С тоже обнаружена чёткая термодинамическая закономерность. В этих операциях участвуют два ОУФ, и у одного показатель nh возрастает на единицу, а у второго он остаётся прежним.
Так вот, правило разрыва связи С-С состоит в том, что из двух вариантов разрыва этой связи между ОУФ с разными значениями nh термодинамически выгодней такой вариант, в котором nh возрастает у ОУФ с бóльшим значением этого показателя.
Утомлённый читатель может поверить мне на слово, что это правило – тоже следствие закона окисления углерода.
4) Остальные следствия этого закона перечисляю уже не конспективно, а скороговоркой:
а) правило отбора для метаболизма реакций окисления,
б) принцип минимизации общего количества разных реакций окисления в метаболизме,
- правила отбора реакций разрыва связи С-С и обратных им реакций образования связи С-С для метаболизма.
Вот эти многочисленные следы, оставленные в метаболизме законом окисления углерода, и подтверждают его полное право на данный титул.
III. Заключение
Конечно, я не мог в нескольких небольших публикациях осветить в полной мере все идеи, находки и все тёмные места своей трехтомной монографии «Метаболизм: структурно-химический и термодинамический анализ».
Но и сказанного, вроде бы, достаточно для возбуждения интереса к этой работе.
Но это лишь «вроде бы».
Сколько раз я пытался донести до мира открывшуюся мне гармонию метаболизма!
1) Несколько статей для отечественных и зарубежных научных журналов.
2) Само издание монографии за свой счёт в 1988 году, выступления в научных институтах, две апробации и защита её в качестве докторской диссертации.
3) Неоднократные попытки опубликовать монографию на иностранном языке в зарубежных издательствах.
4) Краткое изложение того труда в разделе VI моей следующей большой книги – трёхтомника «Аналитическая биохимия» (1996 г.).
5) Популярные статьи…
Всё – почти впустую, на ветер, в никуда…
Да, докторскую степень и профессорскую должность, благодаря этой работе, я получил.
Но ведь не только ради хлеба насущного… и не столько…
– Тень глубокая, накрывающая всё целиком…
Что ж, так бывает.
То ли это, действительно, не нужно ни сейчас, ни потом – как это случается с большинством докторских диссертаций.
То ли время ещё не пришло. А придёт ли, узнать уже не суждено.
Я не жалуюсь. Я только констатирую, как на данный момент обстоят дела с моим первым научным детищем.