В 2004 году защитил докторскую диссертацию - "СОЧЕТАННЫЕ РЕФЛЮКСНЫЕ НАРУШЕНИЯ ВЕРХНИХ ОТДЕЛОВ ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНОГО ТРАКТА: МЕХАНИЗМЫ РАЗВИТИЯ, ПРИНЦИПЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ"
Основные работы (книги и статьи)
1. Остапенко В.А., Ахмедов В.А., Баженов Е.Е., Волковская Н.Е. Лечение болезней легких / Под ред. проф. В.А. Остапенко. – Москва: ООО «Медицинское информационное агентство», 2005.
2. Сорокина Е.А. Висцеральные и гуморальные нарушения при синдроме раздраженного кишечника / Е.А. Сорокина, В.А. Ахмедов. Омск, 2005.
3. Ахмедов В.А. Патофизиологические и терапевтические аспекты хронического панкреатита: Учеб. пособие / В.А. Ахмедов, Н.В. Ширинская, В.М. Шадевский. Москва: Анахарсис, 2007.
4. Ахмедов В.А. Рефлюксная болезнь и органы мишени. Москва: ООО «Медицинское информационное агенство», 2007.
5. Ахмедов В.А., Винжегина В.А., Судакова А.Н. Нестероидная гастропатия, энтеропатия и гепатопатия: Учеб. пособ. Омск: Изд-во ОмГМА, 2007.
6. Ахмедов В.А., Бунова С.С., Остапенко В.А., Сосновская Е.В. Функциональные заболевания верхних отделов желудочно-кишечного тракта: Учеб. пособие. Омск; Сургут: Изд-во ОмГМА, 2008.
7. Березников А.В. Экспертиза случаев оказания медицинской помощи при патологии желудочно-кишечного тракта: Учеб.-метод. пособие / А.В. Березников, В.П. Конев, В.А. Ахмедов. Омск: Изд-во ООО Мираж, 2008.
8. Судебно-медицинская экспертиза случаев оказания терапевтической помощи: Учеб.-метод. пособие / А.В. Березников, В.П. Конев, В.А. Ахмедов, В.В. Сорокина, В.В. Радул, Ю.О. Онуфрийчук, И.В. Письменный. Омск: Изд-во Мираж, 2010.
9. Клинико-фармакологические основы современной пульмонологии: Учеб.-метод. пособие / Под редакции Е.Е. Баженова, В.А. Ахмедова, В.А. Остапенко. Москва: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2010. 10. Ахмедов В.А. Практическая гастроэнтерология: Руководство для врачей. Москва: ООО «Медицинское информационное агентство», 2011.
11. Ширинская Н.В., Ахмедов В.А. НПВП-гастропатии: проблема диагностики, лечения и контроля качества оказания медицинской помощи: Монография / Н.В. Ширинская, В.А. Ахмедов. Москва:РИО МГУДТ, 2011.
12. Основы клинического диагноза при заболеваниях внутренних органов: Учеб. пособие / В.А. Ахмедов, В.А. Винжегина, С.Г. Галютин и др.; под ред. В.А. Ахмедова. Москва: НИЦ ИНФРА-М, 2013.
13. Клинико-фармакологические основы современной пульмонологии: [учеб. пособие] / ред.: Е.Е. Баженов, В.А. Ахмедов, В.А. Остапенко . 2-е изд. Москва: БИНОМ. Лаборатория знаний., 2013.
14. Неотложная помощь при заболеваниях внутренних органов: Учеб. пособие / Под ред. В.А. Ахмедова. Москва: НИЦ ИНФРА-М, 2015.
