В 1974—1981 гг. — диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук "Диагностика и лечение спаечной болезни брюшины"
В 1982—1989 гг. — диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук: "Совершенствование диагностики и лечение сочетанных хирургических заболеваний"
1990—1996 гг. — совершенствование профилактики рака, скрининг (научные публикации, противораковая программа РБ, диссертационные исследования);
1997—2006 гг. — совершенствование диагностики и лечения рака органов пищеварения, легкого, молочной железы (научные публикации, патенты, диссертационные исследования);
2006 г. — хирургия метастазов и путей метастазирования (патенты, научные публикации, диссертационные исследования).
Основные работы (книги и статьи)
Автор более 900 научных трудов.
Ганцев Ш.Х. Онкология: Учебник для студентов медицинских вузов. Москва: ООО «Медицинское информационное агентство», 2006.
Ганцев Ш.Х., Давыдов М.И. Атлас по онкологии.
Ганцев Ш.Х., Давыдов М.И., Вельшер Л.З., Поляков Б.И., Петерсон С.Б. Онкология: модульный практикум.
Ганцев Ш.Х., Плечев В.В., Ганцев К.Ш. Нестандартные операции в абдоминальной онкологии
Обладатель более 60 патентов Российской Федерации и Республики Казахстан на изобретения.
Участие в общественных организациях и проектах
Член Общественной палаты Российской Федерации и Общественной палаты Республики Башкортостан Председатель Общественного научно-технического совета технопарка ИЦ Сколково
Заслуженный деятель науки Российской Федерации
Член-корреспондент Академии наук республики Башкортостан
Главный редактор журнала «Креативная хирургия и онкология» (входит в перечень ВАК)
Главный редактор электронного журнала «Креативная онкология и хирургия»
Член редколлегии журналов «Российский онкологический журнал», «Паллиативная медицина и реабилитация», «Медицинский вестник Башкортостана», входящих в перечень ВАК, «Поволжский онкологический вестник», «Тюменский медицинский журнал», трех иностранных журналов,
Главный редактор журнала «Креативная хирургия и онкология» (входит в перечень ВАК)
Главный редактор электронного журнала «Креативная онкология и хирургия»
Председатель правления Общества онкологов до 2014 года, председатель проблемной комиссии «Онкология»,
заместитель председателя проблемной учебно-методической комиссии «Онкология» РФ,
председатель диссертационного совета.
Основные награды, премии
В 2007 году Ганцев Ш. Х. с соавторами был представлен к Государственной Премии Правительства РФ
в области образования за разработку и внедрения обучающее-контролирующего комплекса «Онкология».
Лауреат телевизионной премии «Герой нашего времени — 2008»
Награжден орденами Почета,
«Labore et Scientia — Трудом и Знанием»,
медалями «Профессионал России», «За заслуги в развитии медицины и здравоохранения», «За мужество и гуманизм»,
дипломом Российского фонда паллиативной помощи «За создание научной школы».